Ако католичку и православну цркву карактеризира строга вертикала моћи са јасном дефиницијом дужности свештенства у односу на друге, онда је у исламу ситуација много компликованија. Не постоји једно поглавље, као што је римски папа у католичанству, одвојене жупе су аутономне, тако да се рјешавање контроверзних питања и развој заједничке стратегије одвија кроз преговоре и компромисе између појединих муфтија Русије. У време Совјетског Савеза, они су били уједињени у једну структуру, али су тада центрифугалне силе одједном изазвале формирање неколико жаришта руских муслимана, чији су односи далеко од идеалног.
Човјеку који је далеко од разумијевања црквених односа чини се да постоји један духовни вођа руских муслимана који се редовно појављује пред објективима фотоапарата и честита цијелој исламској заједници на великим вјерским празницима.
Међутим, шеик Равил Гаинутдин, који је на челу Вијећа муфтије у Русији, заправо није апсолутни ауторитет међу руским муслиманима. Ова организација, коју је основао 1996. године, уједињује само 15% исламских заједница у земљи.
Муфтије Русије дјелују самостално и не гледају уназад на највише власти. Сама суштина СМР-а предвиђа могућност да се одвојене структуре остављају без посебних посљедица. Погрешно је посматрати председника као неку врсту аналогије патријарха Кирила и преувеличавати његов утицај на представнике другог највећег броја следбеника религије у земљи.
Савет муфтије у Русији је велика координациона организација која уједињује муслиманске свештенике из различитих региона земље. Она окупља скоро 1.500 примарних муслиманских вјерских заједница које дјелују од Калињинграда до Владивостока. Ову структуру предводи шеик Равил Гаинутдин, који је и предсједник муслиманског вјерског одбора еуропског дијела Русије.
У епохи формирања, сваки предсједник одвојене духовне управе муслимана, који се придружио структури организације, аутоматски је постао копредсједавајући Вијећа муфтије Русије, али је данас одређен коначан број високих чинова у хијерархији. Сада постоје само четири копредседника, они су муфтија Башкортостана, муфтија азијског дела Русије, муфтија Саратовског региона и муфтија Северне Осетије.
ИДА обједињује углавном муфтије у регионима у којима муслимани нису доминантно становништво, а једини изузетак је Башкортостан.
Обука свештеника врши се у исламским универзитетима под надзором Вијећа муфтије Русије. Највећи од њих се сматра Московским исламским универзитетом. Поред тога, ту је и Руски исламски универзитет у Казану и Нижњи Новгород. Средње образовање у духовној сфери можете добити и захваљујући специјализираним образовним институцијама у Москви, Низхни Новгороду и Саратову.
У оквиру СИД-а дјелује јавна организација под називом Унија муслиманских жена Русије, на челу са Наилом Зигансхина.
Ријеч муслиманских пастира масама вјерника проширује се кроз производњу тисканих публикација под надлежношћу ЦМП-а. То су издавачке куће "Медина" и "Исламска књига". На интернету се налази радио канал Мирадио.
До недавно, ЦИД је имао прилику да се обрати свом стаду кроз кратак трансфер "муслимана", који је излазио на други федерални канал. Међутим, његов формат је био прилично специфичан, првенствено фокусиран на татарско становништво, дотакао се питања која су била незанимљива за већину руских муслимана. "Муслимани" практично нису гледали на Сјеверни Кавказ, гдје је концентрирана већина исламског становништва Русије, а муслимани на руском језику у Земље ЦИС-а. Логичан исход је био затварање не превише успешног пројекта.
ПР менаџери Савета муфтија у Русији проводе прилично агресивну информативну политику на својим службеним страницама иу медијима трећих страна. Резултат тога је заблуда о правом оквиру моћи Равила Гаинутдина. Чак и лидери ДАЕСХ-а (организације забрањене законом на територији Руске Федерације), који су Русију прогласили непријатељем број један, сматрају предсједника РМЦ-а главним муфтијом у земљи.
Међутим, врховни муфтија Русије Талгат Таџутдин, вођа Централног духовног одбора муслимана Русије, потпуно се не слаже с непомирљивим милитантима, као и са идеолозима Равила Гаинутдина. Такође, независни и утицајни муфтије република Сјеверног Кавказа су међу сумњивим поштовањем шејха, међу којима се посебно истиче представник Чеченске републике, гдје су положаји религије посебно јаки.
Подела је почела почетком деведесетих, када су регионалне организације муслимана у европском делу Русије, на челу са Равилом Гаинутином, објавиле своје повлачење из Централног покрета демократских синдиката. Од тада се спор конфликт између високих свештеника наставља, а питање главног руског муфтије остаје отворено.